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上海仁東醫學檢驗所試用Bioruptor Pico核酸剪切儀

比利時 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸剪切儀試用概述

 

 

 

試用日期:20174

試用單位:上海仁東醫學檢驗所

試用詳情:

Sample volume: 100 µl

Tubes: 0.65 ml Bioruptor® Microtubes (Cat. No. C30010013)

Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor® Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes

DNA concentration:  10 ng/µl

Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0

Target size:200bp

Sonication cycles: 13 cycles (30 sec ON/OFF)

試用結果:

樣品品質良好,超聲效果理想,同時客戶這邊正好有競爭品牌M220的保存數據,對比結果基本一致,集中度也不分伯仲,大家的一貫印象是由于M220必須使用高昂的原廠樣品管,同時一次只能處理一個樣品,在集中度方面絕對更勝一籌,包括我們公司同事也或多或少如此認為,可惜大家都錯了!

Bioruptor pico這次證明了它自己是最棒的,對此誤解同事們由衷地感到有些內疚。

 檢測源數據

 

20170421仁東檢驗所.pdf

 

20170421仁東檢驗所Pico-M220.pdf

 

 

 

 

 

 

 

 

 

儀器正在預冷……

 

朱老師正在用毛細管電泳儀檢測……

 

 

結果分析:以211這個樣品為例來分析

 

樣品211,目的片段200bp,按照廠家參考循環數13 cycles (30 sec ON/OFF),峰值稍稍拖后,故在此基礎上猛地增加超聲循環數5 cycles (30 sec ON/OFF),同時更換了marker后,檢測結果請看下圖。

 

 

covaris M220保存數據如下圖:

 

 

211樣品與競爭產品covaris M220保存數據整合對比圖如下:

 

紅色是之前某B樣品的covaris M220保存數據,藍色是211樣品的Bioruptor pico超聲18 cycles (30 sec ON/OFF)的檢測數據。濃度方面211樣品比較高,集中度方面兩者差不多。藍色211樣品的波峰往前傾,存在明顯的過度超聲, 由此判斷循環數在13-15 cycles (30 sec ON/OFF)區間即可。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 
 
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